周记5

7.31-8.6

都没想起来写。

这几天实验室只有光老师、张咏妍、我和老板。MRZ的文章终于要投出去了,给我发了Manuscript,看文风是Science,几个月前我说过不要挂我的名字,最后还是挂上了。

8月5号去听了朱老师讲了一下文章内容,重点放在ZNF512和ZNF512B通过non-consecutive的TTC实现在不同物种(结合序列差异大)中的功能保守型,都能招募Suv39h1和Suv39h2实现pericentromeric hetero-chromatin 的建立。

我这几天主要在做:

  1. PX320-GFP-sg1~10包病毒
  2. Pb-Cas13d-U6N-mCherry质粒构建C1\C6不成功的问题,质粒中两个序列相同的SV40 polyA site之间的区域非常容易丢失,元载体换成了bGH polyA signal。
  3. Des-V5-MCP-APEX2-IRES-BSD的稳转、然后单克隆打板。
  4. Overexpression了HA-RTCB和HA-ASW的N1,N2,C1,C6稳转细胞系构建。需要了加dox诱导Cas13d表达后C1和C6大量死亡的情况,之后可能重新构建了。dox浓度降低。

龙新、宇泽、雨涵返校了,万坤走了。

8.7

早上醒得很早,不到八点到了实验室,整理了一下第五周战报。然后十点钟去新水利馆找了杨老师,约了明天下午一点去清河管理处谈水域。下午做了流式打板MCP-APEX2,真快。十分钟就分好了3个96孔板,据说是我的细胞没有荧光所以快。然后提了很多很多质粒。意外地发现polyA change的Cas13d-mCherry没有长起来。收了PX320-GFP的48h病毒。去找宇泽去31号楼练了几组胸和二头。然后去龙船码头吃了火锅。聊了很多课题上的事情。非常值得我注意的是,宇泽提醒我L1RNA的二级结构可能是被特异识别的原因。还有有没有可能只是因为L1 RNA特别长所以被检测到了ligation,其他的小RNA都被质控过滤掉了。跟宇泽交流了一下,我发现自己对课题背景的了解还差得远。

8.8~8.13

讲完了组会。然后周六日给自己放了两天假。周三周四也基本没做实验,本来是留出来给组会的,但是实际上都在宿舍床上颓过去了。