我用beads只做过两件事：第一件是把DNA和RNA从PCR反应等“脏”溶液中纯化到low-EDTA TE中；第二件是对dsDNA进行片段分选。
长久以来我只知道beads优先结合大片段DNA，所以用0.8x体积的beads就能去掉引物二聚体。但对于更细致的原理就不求甚解了，只懂得照建库试剂盒规定的第一轮、第二轮beads体积比例机械操作。
比如在300～450nt的dsDNA片段纯化中，第一轮是0.3x，第二轮是0.2x，这一度让我很迷惑：第一轮“去掉”了大片段，第二轮理应结合更小的片段，beads体积怎么反而降了呢？
这次有机会用beads做一个试剂盒之外的片段分选，没有任何数字可以参考，才开始认真了解其中的细节。
原来，真正发挥“片段分选”作用的不是beads本身，而是它所在溶液中的PEG浓度。第二轮虽然只加了0.2x的beads，但第一轮的PEG也被一并带入，溶液中PEG浓度实际更高，于是更小的DNA片段也析了出来。
（最后还是闹了个乌龙：按二代测序建库试剂盒的参考值美美地算完，结果什么都没回收到，这才猛然惊醒——试剂盒里的0.3x和0.2x是基于上一步adapter ligation体系的，ligation buffer本身就有高浓度的PEG，所以我实际加的量低于所需。）
有话这里说 ↓