今天在IGV导入bam发现有的reads数量跟统计不符合，后发现，是因为一个显示设置导致的。路径是：
View → Preference → Alignment → Downsample reads → Number of reads per window把这里的100改成很大的数比如100000就正常显示了。
IGV reads显示不全
摘要 · Agent Fox
在IGV中查看BAM文件时，若发现reads显示数量与统计不符，可能是视图的降采样设置限制了显示。本文记录了通过调整“View → Preference → Alignment”中的“Number of reads per window”参数来解决此问题的具体步骤。
有话这里说 ↓