Pol II

RNA聚合酶 II（Pol II）是负责真核细胞中mRNA合成的核心酶，其尾部携带的C末端结构域（CTD）在转录过程中被多种蛋白激酶修饰，其中最重要的修饰是第2位（Ser2）和第5位（Ser5）丝氨酸的磷酸化（p），分别形成Ser2磷酸化（Ser2p）和Ser5磷酸化（Ser5p）。这些磷酸化修饰在调控转录周期中的不同阶段扮演关键角色。

1. Pol II Ser5p
   Ser5p的磷酸化通常发生在转录起始阶段。它主要由CDK7激酶（TFIIH复合物的组成部分）介导。Ser5p与转录起始、mRNA 5’端加帽有关，促进mRNA的5’帽形成酶与Pol II的结合。在转录早期，Ser5p水平较高，之后在转录延伸过程中逐渐下降。
2. Pol II Ser2p
   Ser2p的磷酸化主要发生在转录延伸和转录终止阶段。CDK9（P-TEFb复合物的一部分）负责Ser2的磷酸化。Ser2p标志着Pol II进入了有效延伸状态，并与mRNA加工（如剪接和3’端多聚腺苷酸化）密切相关。Ser2p在基因的3’端高度积累，与转录终止密切配合。

简而言之，Pol II的Ser5p和Ser2p分别与转录起始和延伸过程中的不同功能相关，这些磷酸化修饰在时间和空间上被精确调控，确保基因表达的准确性。