窗花不可幽禁落霞

2025.7.2

今天打印出来第一次自己建模的作品，当然也不能算自己建模，99%的工作由AI完成，工作流是这样的：

图片→GPT-4o转立体风格二维图片→Partpacker生成glb格式立体模型→导入blender调整，导出stl格式→导入bambu studio切片→3D printer打印

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最近感觉又飘了，整天玩3D打印……不学无术，整理一下接下来要做的东西：

1. 马上掌握高效文献搜集工作流；
2. 搜集DNA repair相关文献，准备7月11日组会报告，outline:
   • 1) DNA repair review
   • 2) DNA repair related proteins in my screen hits
   • 3) research plan at this field
3. 确定XYY的科研训练课题
4. 回复老板上周发的PLOS One审稿的复审
5. 我没有交年审报告

2025.7.1

因为我的partpacker每次要跑40多分钟，想要换个好点的显卡，gemeni老师推荐我用4070Super，换了显卡之后还需要换个大功率电源。都在闲鱼买了。

2025.7.2

Openscad真是好用啊

2025年了，学习建模肯定想能跟AI结合。开始是搜到blender里面有一个python API可以通过编程来控制建模，测试生成一个骰子，结果花了五美刀的anthropic API只生成了图二的那一坨。。。 后来问了问豆包，说用openscad试试，结果一次就成功生成图一，后来优化了一下细节（图三），打印出来还挺好看的。 发现Vscode还有openscad的插件，直接能用Cline编辑代码了。

打印出了一个狐狐：

透明材料一点儿都不好看，后来换了白色的PLA漂亮多了，不过后来也拿这个吐了色，效果一般般吧。

2025.7.3

很好啊blender！

我13400的U 配32GB内存，点了个remesh之后原地卡死，风扇猛吹一下，然后鼠标都动不了一下

拼多多下单了一些3D打印用的工具，还有丙烯笔：

2025.7.4

今天开始疯狂学习comfyUI+Flux Kontext dev了，后者据说是6月28号才开源。

然后了解到Sparc3d的图片建模能力比partpacker要更强，但是前者不开源，目前只有官网试用。我拍了500多号的队，终于排到了，最后效果真的要更好一些（而且还是因为人太多砍了精度的版本）。AI技术发展真快啊。

简单用笔刷修了一下：

我打算后面电脑模拟一下贴图，看看效果好的话，再把衣服扣子补全成一个倒着的胡萝卜，雪人也加一些凸起，后期方便填色，应该效果是非常好的。（还要注意重心，应该可以把脚和尾巴底部对齐，三点支撑）

2025.7.5

今天4070S和750W电源到了，对了，之前的4060也闲鱼出掉了。1888买的，用了半年1790出了。

今天还开了小红书和闲鱼的店铺，希望靠帮人P图赚钱（话说PS的地位岌岌可危啊，用作动词的时间不知道还持续多久）

2025.7.6

今天接到了闲鱼第一单。一分钱没赚，修了五个小时，最后收了0.1元。我自己还为了用Kontext Pro买了36块钱的API费用。但是，值得，算是对自己能力的投资。修别人的图真的跟自己不一样，自己太容易妥协了。

2025.7.7

不知道是不是因为我在拼多多买的丙烯笔太便宜，颜色涂不均匀。用400目的砂纸打磨了半天，但是层纹依旧特别明显，不过感觉层高还有充分减小空间（上色的是0.2mm层高快速打印的，实际上20cm外用肉眼看已经可以接受了，打到0.08层高应该能非常好了）

晚上学习了Fusion360了，好方便，有意思，自己做了一个定制化挂钩：

2025.7.12

2025.7.15

今天我在拼多多买的二手显示器到了（ASUS ProArt创艺Pro PA279CRV），4K 27寸，比我之前的屏幕好太多了。物超所值，亮度也够（甚至调到60%才稍微觉得不刺眼），之前看VScode那个深色模式总觉得太暗。￥1799买的，是我用过最贵的，但是全新的要三千多。我觉得很赚。

2025.7.18

昨天中午吃饭逛了一圈没啥想吃的，于是点了牛肉丸子面的外卖。等外卖的时候就回宿舍躺着了，吃完继续躺着，不知不觉就从十二点刷手机到下午七点，这时候想着必须去干活儿了。但是又因为玩了太久精神疲惫，就想着睡一个小时到20:30，然后去桃李吃个晚饭去实验室搞综述。但是一觉睡醒已经0:44了，惊呼一声我草！但是思辨一番，如果现在起床干活，一直到晚上九点半开完组会那也太久了，中间免不了精神疲乏，干脆直接睡到天亮再去吧。于是强迫自己还带着没完全醒透的困意继续睡，再醒来就凌晨五点多了。算一下的话睡了10个小时，还是在本来就没有特别累的前提下。我分辨睡够没有有一个判断指标就是我攥拳头攥得紧不紧，这次显然是最紧的一次，好一个神清气爽，即便饥肠辘辘（因为前一天没吃晚饭）依然觉得十分有力。一个长期体会是能明显感觉到，精力跟小时候比不了一点儿了，越长大越要好好保护自己的精力啊，每天其实精力充沛的时间也就那一小会儿，浪费在刷手机上太不值得了。

这次组会我讲的主题是“Learning from the Established Mechanisms of DNA Repair to Understand the Emerging Field of RNA Repair”，第一次极大规模用Deep Research来辅助学习，我感觉对于已经写进教科书的这种知识来说，用Deep Research真的是很好很快的方式，因为知识已经固定了，信息来源非常广泛，幻觉会很轻，即便它真的胡说，也有非常多权威来源可以纠正。AI发展真是太快太快了，我记得三月份左右，我用Deep Research对我的CRISPR Screen hits用GPT-o3的Deep Research进行过一批筛选。当时效果非常一般，而且使用次数多了还会出问题。那时对比了Gemini的Deep Research，后者效果更差。时至今日，仅仅四个月过去，Gemini 2.5 Pro的Deep Research结果已经让我感到很惊艳了。

老实说，我准备地很不充分；老师说，我很有天赋，就是需要实际做出来点成果。其实我一直以为我上周该讲的，直到上周四都紧张兮兮，结果那天光老师突然往群里发了他要讲的文献，我才发现组会排序推迟了一周。不过我都是能拖就拖，所以并没有延迟一周就准备充分多少。

老板又强调我回答问题不能光说不知道，别人问问题是给主讲人面子，即便不知道也应该扯两句，给一个体面的回复。不能抱着“不知为不知”当挡箭牌而摆烂回答。

组会结束后非常轻松，我也提前预计到这种轻松，非常享受地骑着自行车在学校逛来逛去好几圈。本来想早点回宿舍睡觉，但是还不是很困，于是骑着骑着就到了麦当劳。点了一个麦旋风、一包薯条、一包上校鸡块、一杯几乎不热的热牛奶。

今天是周五，最近一直在追灵笼第二季，B站开始跟移动搞了个合作，第一月0.01CNY开通两个月大会员，这种套路见怪不怪了，但还是成功让我忘记关掉自动续费。不过灵笼的制作水准倒真是值得我为它付费。开组会之前我就想，结束之后马上就能看第十集了，不过在麦当劳的时候我没舍得用手机看，忍到吃完又返回实验室打开我的4K ProArt看。这期是森格司令的主场，很有人格魅力。副官小姐姐出场就领盒饭好可惜。我看到这里产生思考，是否我（和社会观念）真的会区别对待男女，一个女人只要漂亮性格好（霸气、温柔都算，只要没有让人不喜欢的缺点）都会被人很喜欢，而且喜欢的是这个人本身，让人有亲近的欲望。而男人的人格魅力会让人钦佩，却跟对女人那种想要亲近美好事物的感觉完全不同。没错，我好像确实潜意识里认为，女人就是配得上“美好”这个词的（当然得是漂亮的女人），男人说美好就怪怪的。

之前我对windows的HDR一直无感，偶尔开过几次，画面一下子就灰溜溜的，比SDR还丑。今天学习了一下，原来是我打开方式不对，一直没有走calibration流程，这次校准完发现果然是宽容度丰富多了。这个显示器又是一次成功消费。

2025.7.19

今天我过生日，起床之后没有赶上早饭，不过不着急，昨晚吃的很多，去实验室直奔Steam，目前只装了一个地平线5，我很难玩进去这个游戏。

玩了两把比赛之后开始打红警（当然我只能打电脑），北极圈苏俄1V3韩国，一直死啊，矿场总是被炸。后来我悟了，放再多放空棍都没用，必须要把纵深拉长，给放空棍一路发力的机会才能避免矿场被炸。虽然如此，最后一局我还是只剩一个重工，基地、矿场、兵营都丢了，更关键的是，两边的桥都被我拆了，没有兵营意味着我没有工程师可以修桥，于是困死在地图右侧。左边剩的两个韩国也炸不死我，因为我可以出很多防空车。

翻盘的关键是我偷的一个盟军重工，可以出夜莺直升机。当然，靠直升机也是打不死人的，因为我没有经济来源，不能出一万个直升机（08老梗乱入）。但是，直升机给了我全图捡箱子的机会，只要我捡到一个基地，游戏就结束了。这个东西太看人品了，只有一个真人玩家时刷箱子的数量非常少，我一直在切屏，感觉睫状肌非常卖力上下左右拉动眼球。我其实很快就捡到一个基地，但是当时不知道怎么想的，非要把基地拖到地图右侧家门口，导致路上被坦克击杀。如果再来一次，应该原地展开，然后往家里放一个兵营，然后基地使命就结束了，只要我能造工程师，我可以用夜莺占领上下方的四个油田和两个飞机场，有经济之后，屯够兵修桥就赢了。

这种只差一点就赢的局面太让人难以释怀，我于是继续捡箱子，最后足足跟电脑熬鹰了3小时20min，直到最后我也没有捡到第二个基地。但是靠着一辆地图左侧的V3赢下了游戏，因为没有建筑目标的时候敌方陆军是不会行动的，用V3很快就炸出3星，收拾掉两个对面基地了。这之后又出意外，因为担心我的脆皮V3太深入被坦克打死，我把对面的两个桥也断了。导致最后剩一个空指部和兵营实在打不到。这时候我完全可以靠夜莺磨死这两个建筑了。但我有时候就是有奇奇怪怪的执念出现，我非要捡到一个基地不可，即便捡基地是为了赢，而我已经赢了，但我就是非要把没捡到的基地捡到。这个举动让我结束游戏的时间翻了倍。最后如愿以偿，我也错过了吃午饭的机会。打完走在路上感觉灵魂都是飘的（因为低血糖）。

这时候我心情很不好了，因为我又饿又累，本来只想玩两盘顶多一个多小时放松放松，但是我生日的大半天就这么过去了，连顿饭都没吃。原因只是我想要用计划的方式赢得游戏的执念。我觉得这是我的一个人格缺陷了，不分青红皂白地定一个必须撞破头、撞死也要实现的目标，这欲望超过目标背后的收获本身，而只是为了实现而实现。就像我爱她，爱到最后，她很生气，我很伤心。

回到宿舍点了一碗牛肉丸子面，我太爱这一口了，去年北京还没有店，我买过两次真空包装的，每次吃都很麻烦，需要先去食堂买一个2.5元的打包盒。拆袋后去宿舍加热水，再返回宿舍一楼微波加热。吃完之后汤汤水水要倒进厕所，再把味道很大的垃圾扔下楼。上周猛然发现北京开了几家店，吃过一次汤有点不热，今天点的竟然是烫的，非常开心。

吃完开始睡觉，到晚上八点半又活过来，口渴难耐。我过生日，我要吃好的，去桃李斥资14元巨款买了一大杯酸奶。想着生日还没有蛋糕吃，但美团搜了一下都好贵，最最最便宜的小4寸也要四十多。让自己破费为消费主义买单可不叫对自己好。于是在桃李打包了一个两块五的黑皮蛋糕卷，配个打火机也能凑活用。到实验室开始搞我的Agent-Fox的前置知识学习（Langchain的网课）。直到所有人都走了，发现如果我想要点“蜡烛”，我就需要把打火机插在里面，如果打火机插在里面，我就没有着力点摁开打火机；如果我可以用手摁开打火机，我就不能把它插在蛋糕里，如果我不能把它插在蛋糕里，我就没有一张看起来像是生日蛋糕的照片……最后用酒精灯借位解决了这个矛盾。

我学习了Langchain的init_chat_model, json格式的parser, 还有prompt | model | parser的chain结构，有一说一，比我之前php里手（AI）硬搓的方便太多了，最后学到工具调用，沉不下心了。打算回宿舍睡觉，走到实验楼下发现在下雨，又跑回去，打开白天72港币买的死亡细胞。妈的，这游戏简直是给自己找罪受啊，但确实是有种让人死了还想死的魔力。

2025.7.20

雨下个不停，我不想冒雨回去的九成原因是不想我的公路车浸水。但是早上六点困得受不了的时候竟然雨还没停，只得委屈委屈我心爱的小白。我绝大多数的通宵结束时间是6点20，因为可以去听涛吃五块一碗的猪肉粉。我不知道它为什么能做得那么鲜，欲罢不能，一碗粉一碗粥，常年是我几乎唯一的早餐选择了。后背被小白甩了一大片泥点子，让我燃起给它装挡泥板的冲动，特地观摩了一圈学校里的公路/山地车，发现有挡泥板的十不足一，且非常丑。泥点子是可以忍的，雨天走路也是可以忍的，但是丑是不可以的。睡到中午12点，给自己洗了个澡，又带着湿巾和打气筒下楼给小白洗了个澡。一个月没打气，胎压从70 psi掉到快40了，打完蹬起来省力不少。

说来我真是个喜新厌旧的人。提车当天，我花了几个小时在网上查攻略、反复犹豫要不要给它加锁和脚撑，我确实需要它们，但它影响我的爱车那漂亮的外观。当天晚上去吃牛拉。我把它靠在一堵能够被监控覆盖的墙上，吃饭时争分夺秒，生怕我的爱车被坏人顺走。头一周骑行公里数能赶上这个月的总和，在外面吃饭都要找能目视到的地方。怎么看怎么喜欢。

时至今日，多年媳妇熬成婆。脚撑也上了，水壶架也上了，眼锁也变成廉价的铁锁了。三天一打气变成一个月还得看心情了。

水壶架是自己3D打印的，这机器的待遇也差不多。真没时间学建模啊，开机次数越来越少了。红黄蓝绿齐齐四盘料好久都没用完，锤子、锉刀、尖嘴钳、丙烯笔发挥最大的价值是我拿到手里的情绪价值。不过我倒不觉得亏，我发现我对这些设计精美、价格昂贵的物品是有一种感情在的。小白的前一任被我遗留在地铁站风吹日晒已经好久好久了，我也从来没有拿着湿巾和打气筒给它洗过澡。为什么我会区别对待呢？感觉跟我爱她也差不多，网上老有人说啊，你先爱自己，才有人来爱你。的确，小白前任任劳任怨载了我两年，我甚至不愿意叫它一声小黑。我发现我爱她和爱一只小猫一样，就像成千上万的人会对蹲下揉一揉偶遇的猫咪，也不吝啬付出的半根火腿肠来让小猫被摸的时间久一点，挤着嗓子喊出几十声咪咪只为听一下可爱化了的喵~。不过首先，我只喜欢漂亮的小猫，小猫对我不理不睬也不影响我喜欢她，换句牛逼的说法叫“我爱你，与你无关”。但同时，我可能从没把小猫当人，她要彻底跟我断绝关系，这就不被容忍。这样推理我就知道如何让别人爱自己（是“爱”哦，不是欣赏、敬佩、崇拜），就是成为一只拥有柔顺的毛发和软软的肚皮的漂亮小猫。一下又索然无味了不是。这样推理我就知道如何去爱一个人而不是爱一只猫，对于父母，它叫“尊重孩子的独立性”。对于爱人，它对我来说有点过于伟大了。我做不到。这种包着自私的爱，一下又索然无味了不是。

即将步入吃灰的H2D和已经吃灰的A7M4对我的意义依然重大，我对一件事情祛魅只有得到之后说一句不过如此。得不到我就一直心痒痒，就像那把3小时20分钟的熬鹰局，我知道我在浪费时间，但我就是想捡一个基地，捡不到比输了还难受。

擦完车又过了饭点，去李先生发现上新了“香辣牛肉面”，真好，又是一个惊喜。曾经非常喜欢李先生的香辣笋烧牛肉面，在李先生前后充值过600多块钱，就是为了反复吃这一碗面。后来它突然就下架了，我就很少来李先生了。今天这个香辣牛肉面跟之前的味道一样，除了没有笋，不过我可以接受。

午后看了zhu老师发了德国漫步的扫街照片，有一说一，构图、色彩都不错，拍得肯定比我好，有钱、有闲、有趣、爱体育、做公益、好事迹被广泛报道，即便从任何能想到的社会意义上评价都是绝对的成功人士。但我还是产生：原来这种级别的有钱人，在pyq展示的生活也不过如此。这个不过如此不需要我变得有钱就能脱口而出，我知道这不是我期待的中年生活。

2025.7.21

今天的任务：

1. 推进UPR摸条件的实验
   • 确定TM的存量够做多少次实验，是否需要再次购买(已完成)
   • 计算9个样品组TM加量，计算三个时间段分别三次加药时间，确保收细胞时间不阴间(已完成)
   • 分三次加药12:30(已完成), 4:30(已完成), 8:30
   • 最后统一收细胞00:30，取三分之一去跑个FACS，其他离心后冻在TRIzol Reagent
2. 推进探究一众选定基因KO的RNA seq的实验
   • 确定基因列表，计算质粒浓度用量（上次已经计算好了）(已完成)
   • 根据需要的数量铺板HEK293T到12-well plate(已完成)
   • 如果293的数量足够，12h后（今天晚上）应该就可以转染了(已完成, 我觉得够,晚上可以转染)
   • 质粒提前拿出来离心
   • PMD2G和PSAX2提前计算用量，查看是否够用(已完成)
   • Neofect查看库存是否够用(已完成)
   • 转染
3. 提质粒
   • 上次已经离心好了(已完成)
   • 数量较大，分多次加E2 E3(已完成)
   • 还有两管接的菌一直没放在摇床，在室温放了几天，可能Amp已经失活了，不过我看管底已经有一层菌液了，摇两个小时一起提吧(已完成)
   • 质粒提取完成以后，要都取一点送测序（因为接种的时候可能有交叉污染，混淆），引物mouse-U6(已完成)
4. 安排这一周的任务，理清思路
   • 整理过去做过的RNA seq list，放在周末的work report中
   • 安排一下实验，确保周日前有个FACS图
5. 去健身房
   • 至少做两个大项和一个小项
   • 大项根据同伴动作随机应变，如果他们练得慢，见缝插针完成我自己的任务
6. 闲鱼的电源腰斩了价格终于卖出去了，今天给他发货(已完成)
7. 史老师让我打印一个磁力架的塑料壳子，厂家不单卖，一个新的要4500块，啧啧，真坑啊。

2025.7.25

大前天早上突然接到我妈电话说姥姥死了，让我买最快的票赶紧回去。我今天本来打算学习fusion360建模，把实验室需要的一个不单卖的原价4500的工件做出来。然后下午提RNA并且整理昨晚收的流式细胞仪数据。但是电话里妈妈在哭，而且她很少用这么直接的语气让我做什么事情，所以我还是答应了。让Gemini和豆包规划了一会儿，发现不是很靠谱，尤其是从临汾西站到安泽的那一段网站根本找不到汽车票的信息，我以为全部取缔了呢。晚上我妈和姐姐打电话才知道六点半之前有公交车。不过这时候我已经在一嗨租了一个丰田新亚洲狮，正处在第一次租车的兴奋中，以至于直接回绝了舅妈给我找的顺路亲戚（因为他们怕我夜晚上高速开车危险）。

去桃李打包了一点食物，就去坐四个多小时的高铁了。

到了目的地去南停车场取车，拿钥匙需要先上传驾照图片，但是交管12123上面的电子驾照那一页不能截图，跟一嗨客服打电话说让随行朋友帮忙拍一下，好无语的设计，还好我带了平板。因为上次开车快一年前了，在高铁上的时候就查了半天小红书（买的无座，到处挪屁股）。上车后先找了一下各个按钮在哪，回忆了一下前进和后退是什么档位，然后开去锣鼓桥吃了个晚饭。这地方竟然变成美食一条街了，太繁华了。买了一杯蜜雪冰城的柠檬水，我问摊主货源，她说跟商家谈的合作；还买了一份酸甜麻辣的麻辣拌和一根淀粉肠、一根烤面筋，有车就是好啊，可以带到车里享受。麻辣拌太美味了，北京的所谓“山西麻辣拌”外卖完全不能比。早上睡醒就准备出发了，今天的第一顿，香死我了。

吃完天就黑了，我准备出发去安泽，中间大概一个半小时路程，我刚出发十分钟突然觉得应该回忆一下灯光的使用方法，不然一会要是没有路灯了就尴尬了，所以到路边摸索了一下，原来往里拨一下就是远光了，小红书还说超车前可以远近光切换示意一下前车。

学会了就开始上路，没多久真的没有路灯了，上高速前有一段两车道的路，全是半挂，因为同侧车道就一条，也不敢超车。第一次直观感受到远光灯的恐怖，后边车一照，后视镜的反光就让我整个车厢灯火通明。前面一照，整个视野就剩俩灯泡了。所以后面我都极其注意切换近光不晃别人。

然后结束这段路右拐去匝道的时候我还错过路口了（主要是因为太黑没有路灯），上高速的时候我不知道这车有没有ETC，也从没进过高速，就走的人工通道。然而那大哥理都没理我，那杆子就抬起来了。我有点懵但还是开进去了，这跟小红书上说的不一样啊，不是应该给我一个牌儿，然后下高速的时候结算费用吗。难道是今天免费？直到下高速的时候，那收费站的人没给我抬杆儿，我说“我上来的时候就没给我牌儿”，他给我查了一会说，人工通道也有ETC，你这个已经计上费了。虚惊一场，还以为要罚我的款。

高速上那个道路两边的反光灯带真的神奇，不靠电源就勾勒出路线了，还有那些路边的指示牌，太神奇了，周围都黑黑的，只有路牌锃亮。

晚上在殡仪馆门口倒车的时候，出现了我这辈子第一次油门当刹车，妈的太刺激了，还好我反应快，一脚给踩死，没有磕碰到什么东西。去舅舅家接到我妈，我说明天下午要走，我妈原来希望我再留两天送姥姥下葬，我爸说还计划送走姥姥再接我去奶奶家呆两天。不过我说已经买了票并且我的实验不方便离开那么久。到了殡仪馆，是个露天小院儿，四周有几件小屋子，看到我姥姥已经摆在其中一间的棺材里了，不过是透明的，应该只是临时存放一下。我来的时候还在猜，姥姥是弥留之际还是已经走了，我希望是后者。因为前几个月她给我打电话，我都没接，因为长久以来觉得她说话一点有效信息都没有，基本只会问“吃了吗？吃的啥？”完全是太孤单想找个人说说话，我会同情和怜悯，但这种程度的情感不足以让我付出些什么。如果她还活着，我看到她的眼睛会背负更大道德压力。一堆我不认识的姥姥的兄弟姐妹在旁边坐着聊天，舅舅卷着被子在旁边睡觉。没有开灯，应该是怕蚊虫，外边有光的地方全是大号儿扑棱蛾子。爸妈让我给姥姥磕个头，然后就带我在那里坐着了。什么都不干，就在那坐着。我网上查了一下知道这个叫守灵，送亡者的灵魂走最后一段路。我妈从没跟我说过，但是她好像默认我应该懂这些东西，这种默认让我有一丝疑惑。反正我对参加这种仪式没有一点兴趣，只觉得坐在那里（我又不想跟那些不熟的人聊天）十分尴尬。于是站起来在周围走了走，棺材前面有一个小桌子放着水果，正中是一个插了三炷香的瓷台。两侧有两根巨大无比的蜡烛，还有一圈塑料皮作防风罩，可能是一直到下葬都不能灭的那种。周围有一圈跪垫儿。我走到棺材前想看看姥姥尸体，虽然是透明的、头脸还是被遮住，加上没开灯只有烛光，什么都看不清。

期间我父母偶尔劝我去车里歇会儿，那一圈不认识的老人操着安泽方言让我要不就回（舅舅）家里睡吧（P.S. 我妈在字里行间把住着姥姥的舅舅家视为自己家，我理解她，但我不觉得那是我家）。我当然想去车里一个人自在，但我总觉得走了是不是不道德，于是硬着头皮继续坐着。坐不住了就四处走，期间几次想拿出手机，但觉得万一有些“规矩”不让玩手机呢，直到看到别人看手机我才敢拿出来。外面是个小院子，有两条巨大无比的狼狗锁在笼子里。墙边靠满了花圈，有我认识的，有我不认识的，想来年轻时也有丰富的人际关系吧。有花圈上还有我爸我妈的名字，不过没有我。但是有我两个姐姐姐夫的。按辈分我们是同辈，但没有人通知我要准备花圈，我看他们的花圈样式也是完全相同，应该也不是单独准备的，就是报个名字然后统一买。想到同辈的姐姐有花圈，让我稍微有一点点被排外的感觉，不过也就一点吧。我也没问谁。

无聊和困意终究打过了那一点点来源不明的道德束缚，我还是跑车里躺着去了，并且发现并排的我爸也在他车里躺着了。毕竟还是不想搞出太大动静，车是租的，而且是油车。我还不知道如何在不引发发动机轰鸣的前提下把空调打开，于是开了两侧的车门透风，结果承受了一整夜蚊子的折磨，根本也没有睡着。

中途发现我的网站被恶意代码入侵重定向到了一个博彩网站，因为上不了服务器，只能在wordpress后台通过插件搞了好久，终于恢复了访问（虽然还没有找到攻击源头，不过把能看到的恶意php文件全都删了）。然后差不多就天亮了，陆陆续续来了好多人，比前一晚多得多。偶尔有不认识的人跟我打招呼，还好有爸妈在前面挡着，我是真不知道该说什么。我妈昨天应该是挤在舅舅那个床边度过一晚。现在穿了白色的守灵用的衣服来车里叫我。我进去待了一会，但是因为人太多、天还亮了，我比昨晚更加社恐，没多久就又回车里了。远远听见我妈好像突然在里面哭得很大声，但是下一秒她又能体面地接待来访的亲戚，这是我好佩服的情绪控制能力。我妈发微信说“守灵要到跟前”，意思是我一直在车里待着不合适。但我实在觉得浪费时间，就跟他们说我要走了，这也是前一晚我拒绝顺路的亲戚车的原因。自己有车多好啊，来去自如。爸妈当然强烈反对，尤其是我妈，跑过来指责我不像话——迟到早退，中间还不参与。说我走了我妈如何跟其他人解释和交代呢。我有一点点愧疚，毕竟一个孝顺的人应该考虑妈妈的感受，但因为愧疚只有一点点，我还是一蹬油门离开了。

因为比原先预计早走了半天，去赶高铁前我多了几个小时空闲时间。昨天打卡了麻辣拌，今天正好就去牛肉丸子面。还是那句话，北京的外卖根本比不了一点。

然后去理了个头，理完走在路上看到一家“明良口腔”，临时起意去洗了个牙。有三档收费：50, 168, 268，我选了168。活到现在还没洗过牙，之前好几次想白嫖校医院口腔科，但是太难挂号了。疼啊，真是疼啊，吐了好几次血，不过洗完对比前后的照片确实牙结石一点儿都没有了。然后开始在车里补觉，可能停的地方不对，被交警拍窗户让开走的时候刚好差不多该去高铁站了。虽然我买了25块的“无忧还车”保险，可以不加满油还车，不过我还是想去学一下怎么加油。虽然没去过，但跟着前车总没问题吧。结果进到一半，就有小姐姐招呼我开错地方了，原来我的油箱位置跟前车不在一边，我应该开到那个加油设备的另一侧。接下来的事情我已经根据小红书的教程演练过了，熄火、扣一下左边座位底下的扳手，然后跟小姐姐说加满，然后去里面屋子里扫码缴费，118块6，啧，说贵不贵吧。

还车和返程都没有什么障碍，路上一直在看fusion360的视频教程，不过信号时断时续，最后还是坐着睡觉了。就是后座有三个小孩吵得实在厉害，监护人搁那说半天、乘务员搁那又说半天，一点用都没有。虽然很烦很烦，但是小孩可以一个人过家家那么久，自己的脑子里肯定有个大大的世界吧，这种心态还是值得羡慕。

晚上零点左右，回到lab门口，估算了一下，虽然现在正好转染后48 h，但是因为一共有56个样品，要是感染完病毒至少也得两个多小时。还是明天睡醒再来吧。

2025.7.26

Today’s Task:

1. 提RNA，做反转录和建库到二链合成(已完成)
   • 提RNA(已完成)
   • 测浓度(已完成)
   • 反转录，测试平台期PCR cycle(已完成)
   • 建库到二链合成(已完成)
2. 做毕业推送
   • 询问lky没有提交的人是否还等
   • 把没有写完的引语写完
   • 在秀米排版
3. 整理fusion360学习笔记
   • 直接在wordpress更新
   • 用AI填充笔记里的关键词
   • 从bilibili找到当初有启发的视频，加超链接
4. 整理历史RNA seq data
   • 提供实验日期、细胞系、Treatment（时间、剂量）、样品名、实验者、项目描述（目的、实验设计），建库方法（rRNA depleted RNA seq）、Fastq文件路径（服务器）
5. 规划课题方向
6. 看孙雪妍推荐的tRNA测序的文章
7. 看老板发的manuscript check
8. 规划最近一批56个KO的加TM和纯合KO方案
   • 学习Cas9纯合KO细胞系构建方法
   • 规划时间安排（因为样品数量太多了，而且需要等预实验确定加TM的时间和浓度）
9. 看质粒测序结果(已完成)

2025.7.27

Today’s Task:

1. 细胞换液、计数、取一部分跑FACS分析(已完成)
2. 前一日的15,25,35cycles重新在一块胶上跑一遍(已放弃)
3. 根据胶图确定正式PCR的cycles数（每个引物不同）(已完成)
4. 正式PCR（用2% Agarose跑胶），得到TM最佳浓度和时间(已完成)
5. 写实验记录(已完成)
6. 整理RNA seq data(已完成)
7. 从PCR仪取出二链合成产物，继续建库(已完成到Adapter ligation结束)
8. 赶紧丢掉弄错序列的LSM6-sg2, MED6-sg2, SAMM50-sg2(已完成,不过菌液已经丢了，这几个需要重新构建了）
9. 让Claude给网站杀个毒（已完成）

2025.7.28

Today’s Task:

1. 下午15:00~17:00 EQ FACS富集前20个样品（提前1h准备）(已完成)
2. 完成建库，今天不用送出去（因为这个不着急了已经有qPCR结果了）
3. 晚上Gym搞起(已完成)
4. 校医院挂个号(已挂号)看看脖子
5. 完成毕业推送（已完成,还差Jamie Hilde的赠言没有收集到）
6. 规划课题方向
7. 看孙雪妍推荐的tRNA测序的文章
8. 整理fusion360学习笔记
   • 直接在wordpress更新
   • 用AI填充笔记里的关键词
   • 从bilibili找到当初有启发的视频，加超链接
9. 修复lab website的世界地图(已完成,我看了就没坏,老板那可能网络js加载失败)

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晚上老板来过work report被抓包打游戏了……尴尬

2025.7.29

Today’s Task:

1. 上午10:00~12:00继续FACS XDP 20个样品(21~40)(done）
2. 下午13:30~15:30继续FACS XDP 16个样品(41~56)（done）
3. 做完TM诱导12个样品的RNA-seq Lib-Prep送出去
4. 校医院看看脖子（昨天临时有事翘了）(done)（也许还可以看看黑眼圈）
5. 调查DDR人工诱导（尤其是NER或DSB通路特异性的）方法
6. 看孙雪妍推荐的tRNA测序的文章
7. 整理fusion360学习笔记
8. gym搞起(done)

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拍了片子“颈椎生理曲度消失”，医生看了还说我颈椎左右不正，右边低左边高，可怕。给我开了膏药，闻起来很像风油精，贴上十几分钟之后热乎乎的，隐隐约约可能确实有点缓解疲劳，不过撕的时候太痛了，小红书说可以用护发素润润，我感觉用处不大。

晚上健身房练完去王庄路的卞二小串吃了夜宵，虾尾不错，烤串一般。

2025.7.30

Today’s Task:

1. 做完TM诱导12个样品的RNA-seq Lib-Prep
2. 调查DDR人工诱导（尤其是NER或DSB通路特异性的）方法
3. 看孙雪妍推荐的tRNA测序的文章
4. 整理fusion360学习笔记

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今天啥也没干，睡到下午2点，吃晚饭去实验室待了一屁会就走了，头疼，没力气。回去睡觉又躺床上玩手机，越玩头越疼。我寻思也没吃什么不对的东西，难以理解。睡醒就好了。

2025.7.31

今天又摆了一天。什么也没干（就做了一步片段分选）。老婆对我恶言相向，我伤心了，还拉黑了好多好多微信好友。我想近一两年内我都不会联系她了。

2025.8.9

北京前几周连续下雨，天天下，连续红色预警，看新闻山区还死了人。有天通知让把龙舟搬到岸上，三位新晋队长在群里捞人，只有我响应。我不得不说，你们团结人的本事比我差远了。我那个时候不可能落得如此困局。（当然人家也没指望能捞到多少人，领导们信息总是更开阔的，最后也确实和北体和公园的人搬完了三条船）。

在下了那个决定后，我关在宿舍跟Gemini老师透透彻彻聊了三天，连续好几天没有跟除了自己之外的人有任何交流，总结了很多篇博客文章：意义、虚伪、尊重，我开始重新思考这些我思考过的地方，应该可以称作内省吧。有很多道理我早就知道，但无法知行合一。龙新有段时间的微信个签是“理虽顿悟，事需渐修”，我过去两年，应该有很大一部分莽撞用在了“渐修”上。

我拉黑了上百人，一方面是为了我的单项承诺，另一方面符合我的自身所向。

重建人生的意义框架让我这一周的感觉非常好，我依旧跟其他人的交流非常少，但我并不感到孤独，反而找回那种我的时间非常不够用的感觉。

看到学员群有人转发黑客松报名信息，我虽然不懂编程但还是勇了一把，直接开始凑人组队了。玩呗反正，大不了汇报那几分钟上去丢人。我计划开发一个自动设计引物和克隆策略的Agent，借此学学MCP client和MCP server的简单应用。得奖我是没一点指望。同时我也想看看我的表演性人格能把一个无能队长演到什么份儿上，反正本来也不认识他们，万一搞砸就搞砸了。

OpenAI开源了gpt-oss:120b和gpt-oss:20b两个模型，是gpt-2之后时隔两年第一次开源，20b参数能做到这样的性能应该是非常惊人了，不过我不懂里边的门门道道，反正我的4070super竟然能跑，出字速度大概3~5个字/秒，这就让我心满意足。不过显然我就是追求一个新鲜感，身处这样一个技术爆炸的世界真是幸运，不过我深知我追求这些新东西只能满足新鲜感，屁用没有。我部署和学习的速度甚至跟不上技术迭代的速度。上个月还花了好几天几夜学Flux kontext dev呢，显然它不久甚至已经落后于时代了。这么想AI行业的人说不定也并不幸福，虽然该行业处于世界目光的焦点，里面工作人员可能得累死，还卷不出头。隔了两天出了GPT-5，往前一段时间还有Opus4.1, 谷歌的一个“世界模型”。在gpt-oss拿下开源sota往前不到一周是宣称拿下sota的GLM-4.5，再往前还有Qwen3和Kimi2等。我人都麻了。

感觉自己黑眼圈和眼袋越来越重了，但是查了查（包括眼科医生也说）除了医美没什么好办法。夜骑两趟50多公里感觉屁股要扯了，随手拍一下吧脸还胖乎乎的，天哪我真丑。活该我孤寡至今。

CRISPR Screen的hits验证结果就是一团，乱啊，太tm乱了。全无法解释，甚至平行重复和生物学重复的结果都是相反的，想自sha了。老板倒是很大气，大手一挥就给我10万块，“希望能用完”，我也希望。

睡够18个小时我真是nb啊，起床去上班的路上感觉校园的阳光真漂亮啊，树的影子、骑车的我的影子，都好漂亮。

2025.8.11

Wildcard又黄了，又赔好几百块，在华夏因为上网和支付问题花费了太多太多太多的时间、精力、金钱，很不好。现在用Binance (Google邮箱) C2C买USDT，再转PokePay(手机号)支付，希望能够稳定一点。

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然后我搞了一通才发现PokePay是香港的卡，本来想买OpenAI的API但是人家不卖香港，晕死。最后通过Apple Gift Card去开了GPT-Plus花掉了。然后发现Copilot绑定一张卡可以免费30天Pro，正好cursor过期了，抚慰了我一点心灵。

但是Gemini老师开始收我钱了呜呜：

2025.8.18

上周看到学校一个AI for Science的黑客松，觉得挺好玩就报名了。（有一说一，我越来越不要脸了，明明进入一个完全不懂的领域，就开始作为项目发起人招募队友了）

项目名称叫PrimerPioneer，旨在利用AI大模型解决一切分子克隆的设计方案构建。找到几个队友都不是程序员，什么都不懂的我带着大家开了两次会，感觉大家也很配合，我其实很惶恐。我这么不要脸的原因其实是，我本来就想学习AI Agent的开发，我知道学习最快的方式就是——去当负责人。确实，我这一周的时间全花这上面了，羞愧啊，我不配当博士研究生啊。确实是野路子学习又杂又快，python, MCP, LangGraph … ，但是有啥用啊，跟专业搞计算机的碰瓷不了一点儿，主业都耽误了。8月22~24比赛，我现在都不想去了，但我tm的还是队长，不能放掉。也许这就是所谓“负责人学得快”的一体两面吧。

2025.8.21

我现在床上有台灯、除螨仪、外卖、卫生纸、杯子、枕头、一个放在颈部的小枕头、臭袜子、一个臀模、几包避孕套、一个衬衫、钥匙、钱包、手机、充电线、笔记本电脑、ipad、耳机、游戏手柄、笔记本支架、3D打印的EDC玩具、人体润滑液、插排、治疗鼻炎的喷剂和药片、水杯、治疗脚气的喷剂、一个帽子……小床承担了我太多的生活功能，所以我可以在床上躺三天三夜（真实的三天三夜），中途偶尔尿几泡尿（如果不是瓶子容量不够大）、拿几次外卖。

2025.9.1

据说后天要阅兵，不过我不是很关注。今天早上张姐通宵完遇到张姐聊了聊此事。老板又去开会了，上午临走前给我过了一下hits selection for dTAG cell lines。不让我做RBM7, ZCCHC8和EXOSC5，说这些可以在Discussion讨论方法的有效性，不用深入研究机制。

AI for Science不仅是个黑客松记忆了，今天选hits的时候，尝试代码化（之前都是直接在两个Excel表格里艰难search）。我现实转换成了csv，然后又转换成all_genes_card.json，结构化存储每个hits的数据。然后写了一个简单的flask app，用网页展示这些hits，加入搜索和手写备注功能。随后又围绕这个json，开发了一个MCP server，放入关键词搜索、向量查询、修改备注、获取基因信息等等工具，然后在cherry studio里跟LLM对话，不说效率高还是低吧，心情起码好多了。展示页面比Excel好看多了。

我的博客小助理终于搞的起码可以用了，优化空间还很大，但是它终于可以用了。我从动心起念到现在上线，得有个一两年了吧。倒不是我学习一两年积累了多少能力，而是现在的LLM越来越强了hhhh。目前这几年，因为AI的快速迭代出了个梗。不会的东西，就先不解决，反正马上就有更厉害的模型出来了。前几天还出了一个Grok-code-fast-1，价格太便宜了，对比sonnet和gpt-5基本上便宜10倍往上，我直接磕头感谢了。

Luyao师姐走了。Time flies，已经对人来人往，掀不起任何热情或感伤了。

2025.9.3

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早上起点又遇见张姐了，她对上午十点的阅兵式十分激动，给我讲她提前看到的一些新闻和观景台人群的邀请巴拉巴拉的。（yysy我基本没兴趣，想记录这件事是因为看到了人的兴趣的多样。这件事对于总要把人解构成一模一样的“本性”的我来说很新奇。）

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好的这是两个小时以后正在看直播的我：打脸了。我很感兴趣，排练的也太好了，从那个鸽子的运镜，尤其是80响礼炮，一直咚咚咚，很神奇呢，会被这种精心编排投入巨大的仪式感突如其来地打动，明明一小会儿之前还在心里吐槽这种排练是反人性的。

2025.9.9

Zotero真漂亮啊，真好用啊！我怎么会在endnote蹉跎那么多年的时光啊！前一周还想自己手搓一个包含向量查询、MCP tools的文献管理库，在Moonshot充了50块，结果半天就在cline花光了。最后也没弄成个样子，耽误不少时间。话说之前就听过Zotero，以为是endnote的竞品呢，学校只给买了endnote，就看也没看Zotero，搞了半天是开源免费软件，还有一堆插件生态，我使用下来体验比Endnote高了好几个档……相见恨晚哪！

2025.9.12

啊，突然SAN值好低而且不知道原因，可能没睡好，还有一个月讲组会、而实验一塌糊涂，也可能是陆队短信联系我、我开始承担过去的选择带来的后果。一个月了，四年级了，我连个质粒都构不出来了。我好没用啊。必须开始水生物信息分析了，不然组会要没东西讲了。

组会根本没心情听，好难受。今天来了两个刚上大二的，老板开明地让人家不懂就问，还说好的报告应该让外行也听懂。但你要是一开始就真的事无巨细讲他不想听的东西，可能很快他就不耐烦摆另一种脾气了。我不是抨击他，换我也一样，可能更甚。

最近电脑中病毒了，我连续杀了三天，总是春风吹又生。亲眼看到被远程控制，还有看门狗机制、任务计划、新增用户、改注册表等等。漏洞来源肯定是我的内网穿透xampp，还连累师姐的校园网账号因为挖矿流量被封了（我没有承认，因为我自私大过诚实）。不过，后来我研究了一下区块链和加密货币，真是有趣啊，充满传奇色彩和理想主义的浪漫。

太可怕了，刚才统计之前，我都不知道我在AI花这么离谱的钱，合计1460……

后来发现漏洞可能来自wp_file_manager这个插件，黑客上传webshell后门到我的htdocs目录，然后利用php-cgi执行远程下载木马文件等等。中途还发现我的全部端口是大门敞开的，以及php的root账号没有设置密码等等。属于是生动的网络安全教育了。

2025.9.17

老板专门在第一节课上介绍我，还说我很负责，虽然第一次当助教，但一定能很好地服务大家。我的行为是马上开始下载学生名单，把每个人互动中的信息记录下来。我觉得老板这招很好用。当然可能尤其适合我这种自我意识比较重的人。

2025.9.18

https://squoosh.app 也太牛逼了吧。无损压缩图片大小啊，之前一直用Imagine，远远没有这个squoosh好用啊。

Gemini说的这个观点 ，太有启发性了。体会到了，用一种逻辑，整合不同哲学思想的愉悦感——why到哪里停下，就陷入哪一种哲学基点。why接着why永远不停，就是彻底的虚无

2025.9.22

今天又开始颓废刷手机了，但是上一周真的很充实。不知道这种颓废的触发因素是什么。今天的情况是，本来早上五点多交了work report然后回宿舍睡觉了。睡醒看到老板发微信说下午meet一下，于是赶紧起床去lab。老板说我的实验是鸡肋实验，得不到什么有效结论，我应该把优先级放在dTAG cell line上，不能因为DDR的实验搁置细胞系的构建。他说我的work report也没有用心写在糊弄，但其实，我觉得我已经在精益求精了。我花了很多时间把图画漂亮。少一个小箭头之类的我都会重新去adobe illustrator导出一遍。（不过可能是我对自己要求太低了，这应该是底线才对）。昨晚XYY的细胞污染了，之前一周的工作也白费了。老板让我晚上给他交一个整理的课题工作计划，但是我吃完晚饭就特别想回去床上躺着，我渴望被被子包裹的感觉，即便我刚起床没多久。回去之后很快又睡着了，不过睡了没多久。然后开始躺着刷手机，就那么几个app翻来覆去的刷，我都觉得没意思。

几乎一个月前就想恢复运动了，不过总是以作息不调、不适合开始运动而拖延。但是我又没有主动去调整作息，这玩意太消耗意志力了。本来今天其实能正常一点的，但是晚上的加睡导致现在23点生龙活虎，工作还没开始，应该又要早晨从晚上开始了。新的组会schedule也出来了，还有一个多月，我可能没有任何东西能讲了。唯一做的两个实验老板都不喜欢，dTAG cell line肯定这么短时间构建不完。以及昨天被马蜂蛰的地方肿起来了，奇痒无比……

喔，他还说我偶尔看着也很投入，但是转化比太低，每天不知道在忙什么，没有有效data产出。

2025.9.24

<think>Ok我们来计划一些今天的日程，昨晚睡得非常不错，新注册了一个mono账号，跟狐狐说了我做了Agent-Fox的事情，不过刚才查了几下，还是没有新的使用记录，应该是还没看到消息吧。我今天想做的事情有，把之前因为AI-excerpt的bug导致的style标签错误的文章给修复回来。然后实验方面，要做菌液PCR鉴定，昨天本来说摇菌来着给忘记了，如果现在接的话，晚上22点可以收，所以现在接菌可以的。然后PCR的话，需要先挑菌落，我计划挑很多，比如每个平板8个，那样的话一共就用8*17=136个，需要17个八联排，是个大工程呢。要不就花两个小时来挑吧。这样从12:00开始放摇床。期间可以继续配置PCR配方，我计划先用中间的FKBPV那一串tag先PCR一批，然后用单独上游arm再PCR一次。这样两边成功率就更高了。按照之前测序的结果，连上的概率并不大，可能今天还需要做第二批。但是一下子做二合一太耗费SAN了，所以还是一个一个来吧。我摇上之后开始配PCR体系，配完继续挑菌，这样更快应该。反正这个是第一优先级。然后晚上19:20有助教，我需要提前18:00在群里发上课提醒，然后18:50左右去上课。看一下时间，假设下午15:00开始做PCR, 16:00反应上，17:30开始跑胶，18:30检查跑胶结果，然后送测序？这样时间太紧张了。所以要不改成14:30开始做PCR吧。应该挑菌也不会那么久，也许11点就摇上了。这样留出准备测序样品的时间。对了还有一件事10:00要加dox，哎呀冲突了。那么我计划是先把大管菌液摇了，去里面加dox，然后出来再挑平板。另外还想做deep research，这个放在穿插中吧。还想锻炼，这么看今天会很忙。起步可以就跑步一公里，俯卧撑100，引体10个。也插空位做吧。还想盯一下浩源有没有搞那个internal deletion，这个问一嘴即可，也插空。现在，让我调用AI工具来做一个日程计划表。</think>

<think>OK已经写完了，发现忘记写配胶了，让我手动补充。OK补充完了，看来是充实的一天。然后发现豆包没有把修复文章style标签写进去，摇菌顺序也错了，让我补充。补充完了，没有写吃饭的时间，随机应变吧。我现在开始第一项工作，摇菌（已经测序的）。</think>

<think>Ok现在是13:05摇菌、加dox、挑菌、放摇床、配置PCR体系都已经做完了，并且配了第一批胶（发现需要分两次配胶和跑胶，因为样品数太多）。虽然比预计完成情况要好，但情况并不乐观，因为跑胶时间要翻倍了。让我想想，假设15:30开始PCR，我计划统一设置10s退火，那么一个cycle的时间是25+25+10=60s，升温降温还需要时间，假设是30s，那一共就是90s*35cycles=52.5 min.所以开始点样的时间会是16:30，16:50开始，跑胶20min；第二次点样是17:10，假设17:30开始跑，那么18:00可以查看两次跑胶结果。这样就跟原定时间一致了，留下半个多小时的时间来准备测序样品。好的，让我更新时间安排表。已经更新完毕。</think>

<think>Ok现在是22:30，预定任务除了锻炼和问浩源internal deletion外都完成了。噢博客标签也没改。我现在开始改博客标签，我计划先从收藏的带有音乐播放器的页面开始改，然后是我的即便半年记，它们都有html标签。我都改完了。菌液也拿出来了。已经24:00了，我想今天就结束吧。回去睡觉，我的身体很累了，锻炼就作废了吧。Deep research成功跑了RTCB和SLC7A5的，还剩7个，明天再弄。然后浩源那个我不打算问了，他肯定没搞，还是得我自己来。晚安</think>

2025.9.25

<think>Ok早上好，现在是10:13，我们来计划一下今天的日程。首先顺延昨天没做完的deep research, 分装ddH2O, 找universal sgRNA质粒, 提质粒, 实验记录(Gel figure注释), 继续把昨天PCR鉴定比较少的板子挑菌, 调查internal deletion（今天至少要弄清楚lhy的脚本的原理）, 锻炼(越到一天结束时,越没有力气锻炼,应该需要转门划分时间块,而不是见缝插针)。下午谭振海要来，我需要安排任务。我计划他来做菌液PCR和跑胶，我上午挑菌培养。希望能够在19:00前送样，如果我看时间来不及，就接手。他做实验的同时，我可以做提质粒, 分装ddH2O的工作。那么看今天任务挺少的，不过这么想也不对。昨天也光是鉴定了一批菌液，今天如果数量不比昨天少，那么久同样很紧张。现在让我先去挑平板吧。昨天分别送了0~4个菌去测序。我计划对小于等于两个的（N-RAD51, N-RTCB, N-SLC7A5, N-THG1L, C-RAD51, C-THG1L, C-TYMS）再挑8个，对于0个的（N-ELOF1, C-ABL1, C-RTCB）再挑16个。算下来是13个八联排（昨天是17个，看来还是需要抓紧）。今天网站方面打算优化一下AI-excerpt，比如这篇文章就特别特别长，每次我点保存都会请求一次全文input生成摘要，昨天一天花了三块钱多，太离谱了。改完了，还是感觉虽然我为ChatGPT花了三百块，还是更喜欢用免费的google ai studio.测试一下效果看看，应该是没问题。狐狐还是没来看我的小狐。唉…质粒不打算提了，因为成功率捉急，还是等测序更经济。实验记录搞定了，挑菌搞定了。deep research弄了，感觉OpenAI的deep research缩水了好多，还没整理。然后我现在应该去拉屎、跑步）。</think>

<think>唉太失败了，吃完晚饭回来很困，就趴桌子上睡着了。结果一觉从20:00左右睡到24:00……还有好多事情没干呢呀呜呜呜呜呜呜。不行，我要赶紧加个小班把它们弄完。让我首先查看邮箱里的测序结果的第2/3/4次邮件。好的，已经查完了，并且把疑似正确需要加测的摇菌了，打算提完质粒再送测。同时我现在要设计并下单新的测序引物，因为P2A-F这条引物不好用，并且有一些加测区域需要覆盖性更好的新引物。搞完了，原地睡lab了。</think>

2025.9.26

<think>好的，不知不觉就次日（2025.9.27）3:29了，今日我又没有完成锻炼和internal deletion的任务，其他推进也不大。早上在实验室小床上睡得只能说一般吧，本来是脱了鞋的，七点左右听见（打扫卫生的）张姐来了，就穿上鞋把折叠床收起来了一半，继续睡了一个多小时。然后九点会寝室洗了个澡，去上了我当助教的课，然后开始回lab提质粒，从14:00到17:00. 送了加测。马旭泽来构建了之前失败的PX458-mCherry-C-PTPN1-sg，晚上开始设计新的克隆构建方案并下单引物。然后查看前日的测序结果，发现SLC7A5有两个假基因SLC7A5P1和SLC7A5P2，被我误打误撞PCR命中了，虽然悲催，但是很神奇，值得让我抽时间写一篇博客。好累……但是怎么一天就做了什么一点点事情。博客方面把AI-excerpt的LLM model换成更便宜的GLM-4.5-flash了，希望少花一点API费用。另外希望把一系列AI相关的插件整合成一个插件，跟grok-4-fast交流了一小会儿，但是没有正式开始。</think>

2025.9.27

<think>又在lab睡了一晚……不过就地大小睡确实太省时间了，我9:20醒的，去处理FACS细胞，10点的上机预约。要是在寝室睡的，起码八点半得起床。现在是15:01，上午XYY去收的FACS细胞可能又污染了，因为细胞状态很差，而且FACS第一个gate分了三大群，不过上一次的1st round FACS显示，Y306F的GFP要强一些，可能确实存在磷酸化306位点抑制RTCB活性的事情，并且不限于Xbp1这个底物。后续打算做NCCIT中的这个实验。</think>

<think>我草，怎么一转眼又到晚上19:30了啊，今天又没有做锻炼。而且因为两天都在实验室凑活睡的折叠床，现在身体很疲惫，完全不适合锻炼，感觉胸肌那里空荡荡的，肚子那里又鼓鼓的憋憋的，哎呀…………不知不觉就变成油腻中年男人了。今天好像也没做什么实验呢，啊啊啊啊啊啊。时间都去哪了呢。早上是简单收了个细胞然后交给XYY去FACS了，然后看了看测序结果（这东西我能看一个半小时？？）中午干啥了？下午两点回来就在3310打了一把元气骑士，然后呢？下午主要是在ChatGPT指导下做了一会儿internal deletion的探索，但是进度也很慢。晚上六点去细胞间复苏了两个细胞，送了个测序。唉……计划的九篇deep research没整理、APEX2发现历史的博客没写、设计N-SLC7A5排除proccessed pseudogenes的克隆方案没做、引物到了但是N-ELOF1, N-PTPN1, N-THG1L, C-SLC7A5, C-THG1L, C-TYMS的克隆也一点儿都没开始构建。但是我HP快见底了，我必须休息了，不然即便睡一觉，明天的SAN值也比较低。</think>

2025.9.28

<think>早啊，昨晚睡得太好了，不过开头不太好（第一个小时经历了严重的鬼压床），重新入睡之后就很舒服了。昨天临走前还发现一个好消息, demo脚本跑通了，成功获得阳性对照即Xbp1的case，接下来计划先搞出Xbp1s的定量出来（TM诱导下应该增加），测试成功后，就可以用于探索更多这样的RTCB底物啦！现在在提质粒离心中，我赶紧用这十分钟计划一下今天的实验。一会儿下午马旭泽和肖宇岳都会来，做两个不同的实验。我跟小马应该早一点，下午两点开始电转dTAG K562，需要同时转PGMET-donor, PX458-universal和PX458-target。我应该提前一个多小时去进行细胞计数和铺板，以及电转需要的电极杯和试剂。然后，肖宇岳会来转染NCCIT的OE RTCB的Tyr-P突变体，这个细胞可能会非常少，一会儿需要去细胞间检查一下，心里有数。这两个都约到9月30号的FACS，十一就放假没有仪器了，所以刚复苏就开始转染，比较赶。另外肖宇岳上次的K562昨天FACS的第一个gate看起来细胞状态很差，当时怀疑是否细菌污染了，一会儿要去细胞间赶紧看一下，如果真的污染，应该一晚上时间足够长到培养基浑浊了。今天还有的事情，就是把internal deletion那个程序继续推进（我觉得我先跑小测试数据的想法太好了，因为生信测序文件总是巨大，这样更节省时间，我最近不管做生信还是实验都应用了“不求完美、快速迭代”的战略，目前看起来很好，起码让我每天都干劲满满，不会陷入不确定新带来的拖延中），另外就是昨天没做的克隆构建实验，还有N-SLC7A5 pseudogene的排除方案。还有9个deep research和APEX2发现历程。我觉得这些可能还得顺延几天，以及锻炼身体我觉得今天又得鸽了，虽然现在干劲满满，但不过几个小时之后，我就要筋疲力竭了。好在昨晚吃饱后发现胸肌还是有一点点，只是饿的时候会觉得那里空空的。我又给狐狐补发了一条消息（这个账号的3次机会又用光了，当然她还是没有回复，这次她连拉黑都不做了）。</think>

我发现一个很有趣的现象。作为男性，我很渴望别人喜欢的是我这个人本身，而不是我的工具价值或产出。但在这个社会里，男人往往天然被看重的是能力和成绩，很少有人真正关心你这个人本身。

而女性则不一样。第一印象通常是外貌的评价，即便能力不强，人们也可能因为她的外貌，或者因为她本身很可爱、漂亮、善良，而喜欢她。可很多女性却希望别人看到的是她的能力，而不是外貌。

有意思的是，那种单纯因为外貌、说不上为什么的喜欢，可能正是男人所渴望的——一种“因为我是我”的喜爱。

我自己觉得，女孩子天生就是一种很美好的存在，本身就是美的化身和符号。从这种意义上，我也挺希望自己能成为一个“珍贵的东西”。可当我这么想的时候，又会意识到“珍贵的东西”背后往往还是“物品”或“东西”，而这种被物化的感觉，恰恰是女性最反感的。

<think>还有一个笔记可以发，就是发现从genome中克隆出pseudogenes的事情，应该引起注意，很可能有时候意识不到这种错误，后期实验得到错误结论。现在是12:37，因为后天的FACS的13:00，我应该立刻开始电转的准备工作，比如检查试剂、预约细胞间台子、以及计算所用质粒体积、打印protocol等。</think>

2025.10.1

国庆节放假了，不过今天还在上班，昨天晚上六点多下了个早班，然后去芝兰园吃了一顿清青小火锅，一百多块，撑到下楼梯都得端着肚子。今天又睡了懒觉，下午三四点才上班，算是完整放假了。又在youtube看到柴静了，我好佩服她，在没有领导督促、检查、干预的环境中还能坚持自己对自己的高标准职业要求，并产出真正有价值的、且被广泛认可的作品。她的视频经常是一个多小时，但在这个短视频年代，我却不会觉得她的时长过长，不知不觉就看完了，还想看下一个。而且看回忆录，在我的年级时，已经对待职业非常认真和成熟了，感觉自己相比同时期的柴静，还差得太远。我甚至对自己现在和未来的职业都不坚定呢，别谈发展了，一心想着混完博士学位去搞钱。还看到她对陈虻的介绍，他们对于职业，以及新闻工作者对于真实、服务等等理想信念的具体行动，让我觉得自己竟然在“女孩子天生美好”“为什么我对年轻貌美不可抵抗”“对美的追求是否是自私和有悖公平”这些话题上空想，而没有做出任何对现实美好追求的改善行为，而感到羞愧。我总在问why，我虽然可能也会质疑为什么要追求“真实”。但他们在为了具体的观念、具体的理想实践，我觉得他们真的很帅。

不过，现在很害怕公开说自己喜欢什么公众人物了，尤其对这样一个争议人物，容易被喷。另一方面，有时我自己不同阶段对一个人的看法也会不同。这一点尤其在几个月前对灵笼第二集中“森格”总司令的判断上，在日记里我写到他很有人格魅力，但是就在下一集，查尔斯寥寥数语就让我认可了他对森格的负面评价。看来我的情绪和判断是很容易被操控的，在前一级充满英雄氛围感的镜头和配乐中，我下意识就产生‘他好帅’的想法，而查尔斯说的确实有道理，又让我对森格的态度180度大转弯。

茄总简直太有才了，这首APT改编简直神曲，让我带着耳机颠三倒四循环一整天。我计划把它插在本页的9月22日之前。原来的囍帖街也留着，两首就两首，我都喜欢，都放，我的博客我做主。

2025.10.3

2号和3号基本都浪费掉了啊。并没有按照预期做事。昨天是晚上才到lab，发现测序样品没被取走，因为测序公司也放假了。然后闻了一下4号才取样。昨晚在实验室打了好多局红警，然后推进了一点点internal deletion的pipeline，BJD问了我一些课题方面的事情，我又因为自己的无知和与年级不匹配的空洞大脑而羞愧了。就地睡觉，结果今早被老板抓了，让我规律作息，不过可能他觉得我还挺努力，属于是领导的误判了，觉得我在工位就是在干活……看了泡芙方说到英文世界的语料占80%，只混简中网络导致严重信息不足，以前也看到过，需要把掌握英文信息的能力提上日程。

2025.10.4

4号也完全浪费掉啊。连计划都不写了，昨晚熬夜看手机到凌晨五点多，然后睡到下午，继续躺着看手机（刷了个两个半小时的《娶妻就变强，北蛮……》的短句，无脑爽，满足男性的变态需求，然后两个多小时歘的一下就过去了，唉……看完就爽不了一点儿了，砸手机的冲动又回来了），到晚上7点把冰箱里的测序袋放到楼下，然后在lab打了三四把红警。//不过有一说一，小飞机真是盗版资源猖獗啊。

2025.10.7

基本567都在打红警，没有干正事。唯一做的给细胞两天换一次液。然后送测结果看了一下都不对啊，剩下一半也不用继续PCR鉴定了。唉。7号下午15点醒来，老板约饭我没去。来lab处理了细胞，NCCIT OE RTCB mutant的加了dox，打算9号重新跑个FACS。K562 dTAG不是很顺利，9个cell line只有3个明确有mCherry阳性分群。也是约了9号打板加population富集。我明天需要思考一下，是直接打板了，还是等population长一长再打板，会不会直接打板的话，死细胞太多。但是population长大，打到重复克隆的概率是不是会高呢？明天问问GPT。

2025.10.11

今日工作安排：

1. 写实验记录
   • 质粒构建记录
     • 搞清楚C-RAD51怎么回事
       • 挑菌
       • PCR鉴定
       • 送测序
         • 写测序订单（确定测序引物）
         • 转移菌液到1.5mLEP管，根据PCR结果选择送测的号
     • 把今天跟MXZ讨论的结果整理到实验记录
   • dTAG细胞系构建记录
     • 新建一个日志（完成）
     • 转染的记录（完成）
     • 两轮FACS，还有对FACS的分析，如N-RTCB的分群异常事件，怎么打板的（low-mCherry打了一块单独的板）（完成）
   • RTCB磷酸化的实验记录
     • 两次K562电转，污染事件的截图记录
     • 一次NCCIT稳转，两次FACS图，之后的实验计划
     • 给MXZ和XYY的任务安排记录
       • MXZ1: dTAG鉴定纯合子的引物设计（完成）
       • MXZ2: 分析DDR pathway是否特异性的富集在RTCB的screen，还是所有人的screen中
       • XYY1: K562用lipo3000重复实验
       • XYY2: NCCIT细胞培养、冻存、加dox重复实验
       • XYY3: 在RTCB-dTAG细胞系中，OE RTCB的若干个mutant
2. 安排之后的实验
   • dTAG细胞后续population实验计划
     • 鉴定引物的check，from MXZ（完成）
     • 用设计好的鉴定引物来对population粗体基因组进行鉴定，确定好用的引物对用于之后单克隆鉴定
     • 做加dTAG条件下的FACS和RNA seq，看split-GFP RNA ligation rate
     • 单克隆鉴定时间规划表
     • 询问MAPIT计划
       • 找到当初杨乐发的Protocol，看是否过期
       • 判断是否来得及组会之前产出结果
       • 制定实验计划不要不明不白（老板点名了做ASW的MAPIT，必须做，但是我要自己思考）
     • 分析9篇疾病关联的deep research
3. internal deletion规划
   • 整理目前的进度
   • 计划下一步工作
   • 完成一部分今天的推进工作
4. 安排组会ppt准备计划
   • 确定deadline
   • 确定有哪些已经有的实验结果可以放上
   • 确定有哪些
5. 7点前送测序
   • 给1.5mL EP管做标记
   • 转移50 mL菌液到EP管
   • 填写测序订单（T7和SP6）
6. 下单新的N-right arm的引物（已完成）
7. 扔掉旧的N-right arm的引物
8. 下单新的两对PGMET-dTAG质粒的鉴定引物，分别跨上游载体连接位点和下游载体连接位点（已完成）
9. 下单MXZ发给我的dTAG population的PCR鉴定引物（已完成）
10. 搞清楚TYMS和ENOSF1的关系（交给ChatGPT的deep research）
11. 给dTAG population换液（已完成，并且铺板了dTAG诱导，之后可以直接做FACS和RNA seq）
12. 值日（完成）
    • 擦桌子（完成）
    • 细胞间补货（完成）
    • 超净台补货（完成）
    • 细胞间拖地（完成）
    • 给小助理拍照（完成）

2025.10.12

今日工作安排：

1. 对N-RAD51进行菌液PCR鉴定（已完成）
   • 挑菌培养2.5h（已完成）
   • 确定鉴定PCR引物：5923bac-F1, N-RAD51-bacR1(300bp), N-RAD51-right-F, 5926MCS-NrightR (1kb)（已完成）
   • 配置菌液PCR体系（已完成，差菌液）
   • 进行菌液PCR（已完成）
   • 配胶（已完成）
   • 跑胶（已完成）
   • 确定测序引物：T7(通用), pDSRED-N1-R(通用), SP6(通用), mCherry-midF(自备), mCherry-R(自备)（已完成）
   • 准备测序样品和订单（已完成）
   • 测序袋子放到楼下（已完成）
2. 辅助XYY完成K562中OE RTCB Tyr-P mutant的突变体实验（已完成）
   • 22:00前，找到lipo3000的位置，确认库存数量是否足够（已完成）
   • 是否需要预约FACS富集，预约哪一日的（已完成）
3. 23:00时，收集dTAG前后细胞，做FACS，如果FACS明显，直接冻TRIzol Reagent里：发现只有RTCB和ABL1明显，明天再跑一次FACS，给其他三个hits多一些时间，再看是否有影响，48h时必须收细胞提RNA了（已完成）
   • 细胞间处理细胞（如果黄了，换液后取一点点跑FACS，如果不黄，直接取一点点，加培养基稀释后跑FACS）（已完成）
   • 预约郑裕彤医学楼的FACS（已完成）
   • 进行FACS（已完成）
   • （如果FACS表现出预期荧光变化）回到细胞间，将剩余细胞冻TRIzol，于-20℃.（已完成，改到明天冻TRIzol）
   • 在电脑上进行FACS绘图整理（已完成）
4. Internal deletion的工作再推进，直到能够获得一张图
5. 查看前一日的测序结果：归因失败，应该直接改成酶切连接法构建剩余的克隆，在那之前，重新P几个3合1片段，PCR产物测序，确认是否ATAD5-right序列在其中（已完成查看测序结果）
6. 24:00前提交work report（已完成）
   • 确定报告结构（已完成）
     • 回顾上次的research plan（已完成）
     • 整理这两周进行的所有工作
       • XYY的第一次K562 Tyr-P研究
       • XYY的第二次K562 Tyr-P研究
       • XYY的第一次NCCIT Tyr-P研究
         • 这批细胞的第一次FACS结果
         • 这批细胞的第二次FACS结果（已完成）
       • K562 dTAG质粒构建过程
       • K562 dTAG细胞系构建过程
         • 第一轮FACS富集（已完成）
         • 第二轮FACS富集（已完成）
         • 加dTAG前后FACS图（已完成）
       • internal deletion数据分析的探索（已完成）
       • MXZ对于DDR研究价值的分析
     • 找到所有产出图片的结果
     • 分析哪些没必要告诉老板可以丢弃
     • 详细对每一张图的背景、实验细节和结果分析进行论述，写在ppt里
     • 写plan
       • 针对性每一个图，下一步的计划
         • 针对NCCIT Tyr-P研究，重复dox诱导实验，确认实验结果，加更多的对照，然后RNA seq
     • 加页码编号，和XYY和MXZ的贡献声明
     • 检查字号大于18
     • 发邮件给老板
7. 开始准备组会PPT（只要开始一点点就好，眼看日期越来越近，太焦虑了，但是一直开始不了）
8. 把N-right arm的旧引物扔掉，防止与新的引物冲突（改计划了，应该直接改成酶切连接法构建剩余的克隆，在那之前，重新P几个3合1片段，PCR产物测序，确认是否ATAD5-right序列在其中）

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可以立刻开始（没有前置限制）但因时间安排暂且搁置的事情：

1. Agent-Fox的商业化改造（这与博士课题无关，但是我更大人生尺度上的探索——自主完成一个产生收益的商业闭环）
2. 九篇疾病deep research的分析
3. MAPIT seq的实验计划，学习Protocol等
4. MXZ设计的针对dTAG cell line是否纯合的鉴定引物test（这个等师弟来了他自己做吧，而且单克隆还要长一个星期，时间来得及）
5. 构建剩余的9个dTAG plasmid，新的引物已到。

2025.10.14

1. 写实验记录
   • XYY的OE RTCB in NCCIT（已完成）
   • XYY的OE RTCB in K562 （已完成）
   • XYY的OE RTCB in K562 RTCB-dTAG (计划)（已完成）
2. 与XYY一起去跑NCCIT的FACS分析（已完成）
3. 给MXZ准备明日（10.15）的dTAG鉴定引物预实验安排（9:00前完成）
   • 找到裂解的buffer（M5超光速PCR最佳伴侣，聚合美的）（已完成）
   • 查看buffer说明书，提取有效部分发给MXZ（已完成）
   • 整理引物筛选后的Excel （已完成）
   • 筛选后的引物导入snapgene （已完成）
   • 把Excel和snapgene发给MXZ （已完成）
   • 把几份待粗体基因组的细胞pellet的位置发给MXZ. （已完成）
4. 明早（10.15）9点处理XYY的OE RTCB in K562,10:00~10:45去生物新馆317EQ
   • 收集mCherry阳性细胞群
   • （应该数量不多不用离心）放回12-well plate培养
5. 提醒上课（10.15 下午19:20~21:45）
   • 新课表给老板审核
     • 10.31课取消，合并到10.29超长上机课（已完成）
     • 文献讲解时间调整到10.24（已完成）
   • 新课表组织语言通知同学
   • 18:00在微信群发上课提醒、签到提醒、文献时间更改提醒
   • 老板让我布置1~2个作业，我可以多写几个供老板选择
   • 准备签到表（已完成）
   • （可推迟）看一下是否网络学堂所有人都在微信班群里（半完成，刘星宇和唐朝待确认）
6. 还给李想Piggybac helper plasmid（已完成）
   • 先再翻箱倒柜找一下自己的PB真的丢了吗（已完成）
   • （如果找不到）转化一下感受态
7. 给李浩源整理internal deletion的脚本说明（给自己也是一个巩固）
   • 新建一个PPT（已完成）
   • 整理代码包，清理可能引起浩源误会的代码（已完成）
   • 在每个脚本开头写清楚功能注释（已完成）
   • 在PPT里写README（已完成）
   • 在PPT里放前期结果
   • 在PPT里写脚本日后的改进方向，或应用于哪些datasets
8. 调查XACT等RNA的功能
   • 整理有几个需要查的基因
   • 用ChatGPT依次生成一遍Deep Research
9. 给老板国产抗体的list
   • 确定所需抗体的级别（WB？IF？ChIP？）
   • 准备PPT，往里面填充备选抗体的资料
   • 在Abclonal查看抗体，关注validation和reference
   • 思考其他国产抗体厂家，同上操作
   • 对于非常好的抗体，保留一种到PPT即可，不太好的留一个备选，然后去CST找
   • 咨询所选抗体的价格和货期（一千块以下的按官网价写即可，贵的问一下人工经销商）
   • 整理PPT内置一个表格，发给老板，需要包含价格和货期。
10. 日常维护处理细胞
    • dTAG population黄了的扩培
    • N-ABL1-dTAG population细胞计数、冻两管、剩下的高转速离心弃上清带出来准备粗体基因组
    • N-RTCB-dTAG population设计一下实验，如果不黄先不处理
    • 冻存NCCIT中的OE RTCB Tyr-P mutant细胞系（观察Y306是死是活）
11. dTAG plasmid质粒构建
    • N-RAD51新引物设计
    • 其他质粒检查PAM是否破坏（引物是否正确）
12. 18:50去上课

2025.10.15

呜呜呜呜呜 😭 操作失误丢弃了75%的N-RTCB-dTAG population 还把C-ABL1-dTAG population给混了丢掉了 褪黑素并没有让我困，只是身上软软的很舒服。刚才还把冻存细胞的标记写错了，往-80放的时候才发现这么离谱的错误。天呐，我还有多少隐藏的样品搞混之类的错误啊。以后还是rna seq好，起码每次听过转录组可以确认样品没有搞混。马上就组会了，又少一天准备时间，我还一点都没开始。明天三个师弟都来，我没那么多活可以给他们。（代办虽然堆成堆了，但是在短时间安排好他们来的时候刚好有放心交出去的合适的任务这件事情本身又是压力）

2025.10.16

真忙真忙，没时间记日记。上周作息一整个混乱。打仗打的都是后勤，我势要彻底解决节律问题。买了褪黑素，下单了唤醒床头灯。昨晚吃的褪黑素可能真的管用，起码没有像之前一样玩手机到地老天荒。但可能也是我昨天太困了，今天定的早晨7点的闹钟完全叫不醒我，一直到九点半还是十点半我才意识清醒过来。中途好多次往后调闹钟，最后还是想起来要光照唤醒生物节律，开了台灯做背景，手机亮度调到最大，玩了好一会儿才清醒。今晚继续褪黑素，希望我的唤醒灯早点到。

---

晚上做上一链合成去运动一下，出楼发现毛毛雨，地上湿了但完全没有积水，太久没运动，跑了两步胸口就闷闷的，停下来的时候刚好到单双杠附近，做了5个引体和5个臂屈伸，折返。这时候雨已经停了，四下无人，安安静静。穿过天文台下面被雨打湿的石板小路，看着矮矮的发出白光的路灯， 同样矮矮的歪七扭八的小树，顿时觉得清华校园也挺漂亮的，想着这会手上有个相机就好了（不过我知道大概率拍不出什么好照片，但我眼睛看到的确实不输任何Romantic的电影场景啊）。穿过医学楼看到几个留学生一起夜跑，边跑边聊；两个保安在门口一边收拾自行车一边唠嗑；三个学生做完实验从里面出来，半脱手套笑嘻嘻讨论实验结果。我心情挺好。

打算再来一片褪黑素，做做二链合成，下单一下引物，回去睡觉了。明早还有助教课。

2025.10.19

放一个周末可以把一整周调整好的作息给破坏，太讨厌了。看来懒觉不能破坏早起，应当往前挪变成早睡，但是一般放假当天又肯定舍不得那么早交出自由早早睡觉，构成一对难以平衡的矛盾。

2025.10.21

NotebookLM真是太优雅了，Google真是一家伟大的公司。有时候觉得活着很无聊，偶尔看到这些激动人心的美丽的作品又燃起对世界的兴趣。

2025.10.22

今天最大的成就是在没有褪黑素的帮助下，维持了昼夜节律没有乱掉。7点半在唤醒灯的照射下睁开了眼，脑子一片混乱，一直在灯光照射下磨蹭到9点才渐渐清醒。到lab开始处理细胞的时间是9:40左右。虽然起床和上班时间还是很晚，但相比之前“早晨从中午开始”是巨大的进步。我早上迷糊的时候用残存的意识提醒自己，睡到饱就必然会晚上睡不着，回到那个地狱般的作息。昨晚入睡的时候也这样提醒自己，玩到自动关机再睡，必然早上从中午开始。我相信我可以控制的越来越好，打仗看后勤，这不是一个小事。我期望日后不久，可以每天早晨7点就开始工作。

2025.11.3

结束了一场组会和一场不是很顺利的假期。10月31号搞的组会工作汇报，这次又刷新“不充分准备排行”了，直接原因是组会当天和前一天都有实验，而且是两个师弟在做，我不好直接往后推。甚至组会前一天干到凌晨三点才下班。当然根本原因又是我一直说要早早准备但是一直没有真正的开始，这种越焦虑越拖延的循环也好几次了。就讲了四十多分钟就结束了，老板督促大家提问又充气到一个半小时。乌龙是splicing junctions我在bam里看不到，后来发现是没有用STAR生成的那个藏的比较深的bam。组会结束当天还是熬了小夜，把MXZ和XYY的WB显影一起搞完了。第二天本来没想放假的，但是管不住自己了在宿舍直接瘫了整整一天，觉得这样放假也太没有意思了，打算晚上通宵打游戏。来lab已经是21点多了，碰到两个师弟在曝光，又没有得到什么有价值的结果。不过还是继续，steam买了黑猴，等待下载的三个小时一直打红警，黑候玩了两个小时光头和广智都打不过，也懒得去查攻略（其实还是查了的，但是看得我实在是觉得麻烦，并不想为了一个人为创造的游戏付出精力去“攻略”它）。申请steam退款给我通过了，然后XYY说当天过来做WB，到下午两点有其他事，想早上做到封闭，于是9点，我和他一起做了两份dTAG单克隆的WB。我因为一晚上没睡觉，下午昏昏沉沉好像在工位什么都没干。因为担心组会上我用错bam的事情导致lhy伤心，我顺道去把-80冰箱除了冰，看群聊应该是他负责，当赔罪了。（不过第二天他在群里只是发了“已除冰”，不知道知不知道是我除的）晚上又打了一小会饥荒（steam打折只要12块钱），第一晚就死了，因为没有意识到晚上不开灯就会死。后来也在bilibili查了一些攻略，发现跟Minecraft高度同质化，什么收集物资解锁更高级的合成物品，我已经玩腻了。然后打算至少是把一抗加了再回去睡觉呢（过夜孵育好一些），但是太累了实在没有心情，于是还是直接回去睡了。组会结束时还跟lhy说，要不明天去找老板澄清一些，不要影响他在老板那里的印象，不过组会完放飞自我实在也没心情去整理ppt，一直到今天还没搞，挺不好意思。所以通宵后，昨晚睡的很久很久，24点入睡，今天10点多才清醒，朦胧中也看到7点的早鸟等自动亮了，但没有思考把我弄起来的力量。然后起床后又是洗澡，然后把桶里洗好的衣服（已经洗完两天了，还好冬天了，不然都臭了）挂了，然后去吃饭（下午三点多的饭，不知道该称为早饭午饭还是晚饭），去的李先生，昨天也去的，发现打折没有了，换成了九块九30天购买的会员卡，几天去是为了把这九块九吃回来，算了算两次就回本，但还是比之前直接打折要亏。唉，感觉就是很可惜，没有安排好组会，也没有安排好组会后的假期。游戏没有提前准备好，等下载好都已经差不多困了，还不感兴趣。因为放假就要后推工作，所以即便通宵后很困很困也舍不得睡觉，结果也没玩好，也没工作，还把身体弄得疲惫不堪。现在应该是要恢复工作状态了，但是并没有实现预计的休息之后干劲满满。身体也不好，情绪也不好。

2025.11.5

乱套了，放个假作息又乱套了，今天下午四点才到lab。继续褪黑素和唤醒灯走起。以及要去运动，科研嘛，继续拖着。

2025.11.6

今天到达lab时间是12:40，今天不错。不过代价是昨天基本上白费，昨天16点到lab，提了个质粒，WB曝光，然后17点去吃饭。回来没干啥，打打饥荒，到23点回去，睡觉时间是0:50左右。

今天起床时间是7:50左右，被灯晃醒的。然后继续刷手机到11:30去洗澡。今天还干了件事是跟豆包对话了几轮搞清楚了各种基金的分类，在支付宝搞了几个场外基金定投。上回搞基金还是大二大三那会儿呢，搞了几个十块钱的，不到半年亏了二三十于是全卖了。

晚上在桃李吃夜宵的时候，好像看到了马润泽师兄。他一边埋着头吃饭，然后左手在看手机。我先是通过他这种吃饭的体态，还有整体的轮廓，觉得可能是他。然后呢我就坐在那个最角落的一个双人桌那里。时不时抬头看他，他有时会抬一下头，然后我这时候看相貌也有80%的像。但是因为我们已经三年没见过了，所以我其实也不是太确定是他。他那个秃头也很像他。我不敢搭话，其实并不是因为我不敢确认是他本人。而是我觉得我在他面前他太自惭形秽了。他用9年的时间攻克了一个重要的问题，但我已经第四年了，却连问题都没有找到，做一些渴望先射箭再画靶子的研究，而且射箭也是三天打鱼两天晒网。我曾经说过，我也想像他一样继承这种科学精神。我不是为了获得学位而去水生活混日子，而是希望解决一个真实的，能让我自己认可的科学问题。如果6年能解决，就6年毕业，如果7年解决不了，就再读博后或者毕业继续工作。但是现在我的目前的每天的工作状态显然跟我声称的这种科学精神不符合。我每天的工作绝对时间很少，在位的时候也经常打游戏摸鱼，鼓捣博客什么的，然后也很少看文献和思考自己的课题。很多实验还有数据分析都是一拖再拖。这些原因都让我没有勇气去面对他。所以挺有意思的是，我开始是坐在角落的那个朝外的座位，可以面对面看到他。后来我换到我桌子的对面，这样背对着他，他就看不见我了，因为我害怕被他认出来。等我收盘准备走的时候，他已经不见了。几个月前他在微信里曾经让我如果留意到清华有教职，可以把通知发给他。我后来也没有特别主动关注。这次他来可能是已经入职，或者准备一些入职的面试之类的工作吧。我觉得今天他给我带来一种这就是榜样的作用的感觉。他什么都没说，只是出现在那里让我看到，就给了我一种警醒，马上会给我一种要调整自己工作状态的这种冲动。

2025.11.8

我还是不能完全脱离外部评价的困扰，今天去给沃森老爷子送个花，回来发现照片里自己很丑，此为第一件让我难受的事情。在老婆的小红书评论翻到高昶的账号，发现他一作发了Nature，此为第二件。

2025.11.10

晚上和浩源讨论了一个半小时，感觉不错。

看到师妹和bjd整天说悄悄话我的嫉妒心爆棚，虽然我已经有老婆了，但只要有漂亮女生，我就会因为不被主动关注而心乱。

2025.11.12

谭振海转的细胞都亖了……取消FACS富集，还要扣预约费。然后还看见一个艺妙神州单位的预约记录，一个想法突然撞击了我。艺妙神州我去过啊，骑车一个半小时才到的地方，竟然要来清华做个FACS，这不一下就大半天浪费在路上了，对细胞也不好。看来去这种小企业做实验会很痛苦，多年在清华做实验，可能已经忘了身处巨大的顶尖公共仪器平台，毕业后如果不去做博后，可能做实验都没有现在方便了。之前一直很向往去公司做研发，从没考虑到过这个问题，除非世界顶尖的巨无霸药企，很难有清华这样覆盖各种实验需求的仪器设备了吧。

2025.11.18

Gemini 3.0 真神登场！！！！

2025.11.26

Claude Code我的好朋友

2025.11.30

I declare — Tiktok is the best app in the world for English learning!

通义新出的这个z-image模型有点东西啊。速度很快啊，质量很高啊。半年前花了几天几夜学习comfyUI上面的Flux.1 kontext，为此还专门换了两次显卡。结果现在Flux.2更新后已经无人问津了，不禁让人唏嘘，被Nano banana pro无情碾压，甚至在开源届也被6 b的z-image也无情碾压。想来黑森林团队在发布Flux .2时的心情是十分苦涩的吧，半年前自己还是破圈的举世瞩目的存在，区区五个月后就急转直下。回望团队辛苦优化、调试、取得突破的激动的过程瞬间，在面对竞争者更强大的模型时……又联想到很多人可能羡慕AI领域的人赶上了好时候，但是这种好时候，恐怕也不见得有那么幸福。

光老师毕业后继续做博士后来完成课题，难绷。我认为他的课题不像MRZ师兄那样值得如此投入。也许只是碍于老板的压力。我也快面临这种窘境了。

这个月初曾经写过整个十一月都不搞博客了，结果还是因为GPT-5.1, Gemini-3-pro, opus-4.5等接连发布没有绷住想要尝鲜的心情。于是又花了好几个昼夜在这上面。主要工作应该是加入了小狐思考过程的展示、以及重构了后端react-agent-service，抛弃了langchain的抽象层。然后做了多租户的鉴权，为商业化打基础。

课题方面继续一团糟吧，主要是做TM应激和RTCB dTAG处理下的RNA seq找Xbp1-like RNA substrates，实验很成功，但是生物学发现为零。

偶尔觉得，人生苦短，要好好珍惜；偶尔又觉得，没有什么特别想要做的事情，于是游手好闲，浑浑噩噩。

2025.12.1

今天跟TZH讨论了磷酸化影响RtcB定位的Protocol，分配了MXZ和XYY的工作。晚上还跟公主和王子开了股东大会。今天还在X-lab提交了Agent-Fox创业项目的申请。

2025.12.2

昨天又通宵了，因为 Deepseek V3.2 正式版出了，测试下来感觉效果很好，可以。思维链连续思考，然后于是又把其他的模型改了一下，其他的模型原来的思维链也是没有传到同一轮 React 的循环的。下一次 LLm 调用当中的。把这个逻辑给修复了，但是还是现在觉得 Deepseek 变成了性能又好，性价比又高，然后人设啊、说话文本这些都最合适的一个模型，速度也很快。所以我很开心，通宵完改完之后，今天早上吃完早饭，7 点多的时候鼓起勇气把小胡发到朋友圈给大家看，写了这是我做了半年的看板娘，欢迎大家来调戏。但是我等了一整天，一直到晚上看后台的数据，都没有任何一个人，没有一个人哦点进来，然后跟小胡对话，所以我就。比较失落，然后又升起一种这个世界上每个人其实都是孤独的，每个人只在乎自己，不关心别人，我自己也是这样。啊，就是有一丝悲凉吧，尤其是随着技术发展，人们以前那些影像啊，现在这个 AI 都能生图生视频，做的非常好，越发感觉人和人之间的孤立。

转眼又到晚上 8 点了。醒来之后又在床上推了好几个小时。打算点个外卖，然后洗洗衣服。今天晚上还是上夜班吧，不然今天什么都没干。

2025.12.4

今天最大的收获是，指导了tool call并行的巨大优势，以及这一点是通过提示词优化实现的，原来提示词也这么重要。一直以来，我都没有认真对待提示词，这个真的得是字字如金的对待才行。

2025.12.5

2025.12.10

<plan>

首先检查依赖，先制作海报→发在群聊→（过半小时）→找老板签财务表。IF实验需要几个小时孵育二抗，不能太晚开始。其他都没有时间先后依赖。

</plan>

更新今天的todo list:

1. 制作海报（李鑫报告）
2. 找老板签字（李鑫报告财务报销申请）
3. 打印易拉宝（李鑫报告）
4. 提醒上课同学提交作业和课程评教（助教）
5. 整理实验记录（三次IF，之前的dTAG RTCB的TM实验等）
6. 检查昨日提出的“RNA降解论”是否是Unique mapping导致的错误（split-GFP RNA ligation ratio）
7. NCCIT的IF实验做完，拍摄显微图片

2025.12.15

好玩，最近在智谱 AI买了包月（我买了包季）Coding Plan套餐，针对claude code和Cline等Vibe coding Agent上使用时，价格相当诱人。但问题来了——我自己搭建了一个 AI Agent 服务（基于 ReAct 架构的 Python 后端），也想用智谱的 GLM 模型，却只能走按量付费，每次请求都在扣钱。按照官方的配置说明，走套餐用的key是一样的，但是base url不一样，多了一层https://open.bigmodel.cn/api/coding/paas/v4（普通端点没有/coding/），不过我自己用这个端点（不在cline里），也能连通，就是还是会从账户里扣钱。

所以，zhipu一定通过一些东西来区分来源，我让claude code扒了cline发送request的源码

改了半天，发现：智谱通过这 4 个 headers 组合识别 Cline 客户端：

User-Agent: Cline-VSCode-Extension
HTTP-Referer: https://cline.bot
X-Title: Cline
X-Cline-Version: 3.42.0

于是我的Agent也加上 coding 端点，并且用这4个headers来伪装cline，现在 react-agent-service（就是小狐的后端） 走的就是包月流量了。

2025.12.15

去校医院和北医三院看病花了大约九百块，公费医疗，自己一分钱没掏。这样讲我算特权阶层了，心态自然是有病没病瞧一瞧，医生给我做的检查少了我还不愿意呢。于是我脑子里的正义小斗士又跳出来开始批判社会不公了。真正没钱看病又享受不到医疗保障的人群，大病小病都尽量不去医院，到了医院也能少做检查就少做（估计医生也主动给你省钱，拿不准的事情也就侥幸心理不安排检查了）。这样的心态对比不止是个早发现早治疗的问题，甚至也存在医疗资源挤兑的情况。毕竟医生到点准时下班，给特权人士多做几个图个心安的检查，给真有问题需要看病的病人的时间就少了，后者挂号也更不容易了。

但你要让我主动放弃我的特权，那绝对是不可能的，首先我做检查当然也是因为我确实怕自己生病，但你硬要剖开我的脑子，当然也能发现“纯粹想白嫖一下医疗资源”的心理。反正被挤兑的人又影响不到我，我心里同情一下已经是大慈大悲了。所以我会这样安慰自己，首先我并没有多大的特权，目前公费医疗在我毕业后就享受不到了。其次就算我真是一个维护社会公正的斗士，那自己放弃一点权利也屁用没有，仅仅只是获得一种“为伟大事业而牺牲”的自我感动，实际上的贡献还不如把自己身体照顾好然后在自己岗位发光发热，或着从医疗制度、医学发展、医疗资源上面做推动。

想起来中学历史课本上经常提到的改革派和保守派的冲突，进步势力和旧贵族的争端，其实里面的大恶人可能也就是我这样的想法，坏也没有多坏，就是得了便宜于是没有动力去改变罢了。可吃亏的人想要改变，要付出的努力可就多得多了。所以创建制度、制定规则、做“创始人”，其实是非常重要、油水也非常多的一件事情。因为一个制度建立起来之后，即便存在很多结构性矛盾，它也在相当大的程度上有着自稳定性。

2025.12.18

Gemini-3-flash出了，更快、更强、更便宜，但还是便宜不过价格屠夫deepseek，让我无法放手使用。最近陷入严重的工具异化。为了用LLM而用LLM，天天花在项目开发上的时间已经远远大于科研。甚至昨晚达到了一个极具戏剧性的高峰——我想看一篇文章，我觉得可以用claude code或codex进行项目式阅读，也许更好，结果我的服务器带宽非常低，每次读pdf（相当于通过api要上传它到LLM provider）都要很久，所以我花了几个小时的时间去搞pdf解析、文本提取（后来思路又变成直接去Nature网站扒html源码），等到最后困得不行了，论文的信息流也没进我脑子一点儿，只是从pdf变成txt，从txt变成markdown……LLM并没有变成我的大脑算力不足时的共享内存，而是几乎成了信息处理的第一站甚至唯一一站，变成我用工程上的确定性和虚假创造感来逃避思考的借口。

感觉就和实验室“带着筛选找科学问题”一样是一种离谱的勤奋式懒惰，前天接待了浙大李鑫老师来做的报告，晚餐会时他提到这种并非hypothesis-driven的课题在美国是拿不到grant的，虽然他最后也说并不是就哪个好哪个坏，但我主观上就是觉得hypothesis-driven或者problem-driven那才叫科研。不过虽然我前天刚刚如此在内心抨击过，昨晚还是变成“带着工具找问题”。言行不一啊，或者说，人性都是如此，逃避不确定。那既然人性都是如此，美国人也并不比中国人更优秀，也必然是制度或环境塑造的产物。那既然我知道我期望的科研是怎样的，至少我要从自身开始改变，环境就从我这里开始形成。

2025.12.21

今天又去贴海报了，这次负责复旦XSH老师的接待。第三次了，驾轻就熟。有种体会到体制内上班的快感。我做个海报再陪陪老师、再主持主持午餐会、再报告开头讲一两句开场介绍，这种产出怎么也赚不了800块啊。啧。

这两天又在颓，给老板说要调研SOS reporter的可行性，拖了得有四五天才给。我发现我已经离不开Codex, claude code和deep research了。颓的同时是在宿舍搞了三天的微信小程序“小狐paper”，我的评价是纯粹浪费时间（不过已经提交工信部审核能够被搜索到了）。

2025.12.22

每次在服务器跑代码都被conda和node折磨得不轻，我要花时间好好解决这个问题。

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我永远不指望用规则来关爱少数或者保护弱者。所谓的规则都是“上一轮”暴力斗争达成的临时性的停战协议。如果没有劳工暴动，现在也没有劳动法。如果今天工人力量彻底削弱了，明天劳动法就变成废纸。不过这停战协议的第一章总是写满了真善美。

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2025.12.25

明天XSH老师就来了，赶紧上网了解一下午餐会准备哪些背景，看了一会意识到，我紧张个锤子，我是主持人，又不是对话嘉宾。不让参会同学意识到我的存在才是最好的效果，适时引导提问、关注时间、不冷场尴尬就成了。

晚上去调试PPT设备，VGA和HDMI和无线搞了半天。VGA是真该被淘汰了。

2025.12.26

这老师可真爱拍照啊，短短从甲所到技术馆的一路，停下来给他拍了快十次。讲的东西我只能说有趣，还有些解决公众对于开放中国人基因组的舆论八卦内容。但跟其他老师的报告相比专业性不强，中途我一直觉得略显啰嗦。还一直逮着我一个人提问，30亿碱基对我不知道为啥记成个20亿，尴尬。

晚上给他打的车，小助理这次没有帮我立刻垫钱，我得记得问她要。

2025.12.27

也许解决Xbp1高表达引起的细胞蛋白产量降低是个潜在应用？

2025.12.29

第一次看到霍乱时期的爱情是初中的时候傲娇公主送我的，当时并没有留下什么印象，甚至翻没翻过我都不敢保证。今天再看到书中的故事，直接京东下单了。想起余华“他跟鲁迅的相遇就该是30岁”，那我跟马尔克斯的相遇就该是现在。一度认为看到所谓爱背后的虚伪和谎言，其实没有什么纯粹无瑕，一个选择总是辜负一些人的同时宣誓着另一种伟大，阿里萨仿佛该被批判，可跟圣地亚哥面对的问题区别很大吗？

究竟是爱附带着伤害，还是伤害附带着爱。

但是我还是想批判他，不是批判他不够英雄不够壮烈，而是他展示英雄的场景过于平平无奇。你没有才华去跟科学或艺术来证明自己的英雄，你没有雄才大略用权力坚守自己的执着，只是选择了人人都能做的、人人都会做的——爱一个人，来把它表现的很壮烈而已。你用一生去证明水滴石穿、铁杵成针，这依然很伟大，但我觉得，跟别人比起来，很low。

2025.12.30

其实权力也没有那么高大上，小兵也拥有相当大的“实权”，那些让人喊苦连天的杂活累活，本身就是权力来源。

2025.12.31